Är en hybrid COVID-stam bakom Vietnams senaste våg? Inte exakt

Är en hybrid COVID-stam bakom Vietnams senaste våg? Inte exakt

Vi har nyligen hört att en ny ”hybridvariant” av coronavirus har upptäckts i Vietnam, mitt i en ökning i fall i landet.

Varianten beskrivs ursprungligen som en hybrid av virusstammarna UK (nu Alpha) och Indian (nu Kappa B.1.617.1 och Delta B.1.617.2). Men vad betyder detta egentligen? Och om vi tittar på vetenskapen bakom virusbeteende, är en hybrid verkligen det vi ser?

Vad är en 'hybrid'?

I virologi är det vetenskapliga namnet på en hybrid en ”rekombinant”. Rekombination är när två stammar infekterar en person samtidigt och kombinera för att skapa en ny stam.

Denna process är vanlig i influensa, där den ofta kallas ”antigenförskjutning".


 Få det senaste via e-post

Veckotidningen Daglig Inspiration

Det största problemet med viral rekombination är möjligheten att den nya stammen snabbt kommer fram med fördelarna med båda stammarna, och du får till exempel en stam som är både mer överförbar och snabbare vid replikering. Detsamma kan gälla för gradvis mutation, men det tar mer tid.

Nya bevis tyder på att koronavirus kan genomgå rekombination, vilket kan ha bidragit till ursprunget till SARS-CoV-2, viruset som orsakar COVID-19. Det finns måttlig bevisning SARS-CoV-2 själv har genomgått en viss rekombination nyligen, med tidiga rapporter som tyder på en möjlig rekombination händelse mellan en Alpha (B.1.1.7) och Epsilon (B.1.429) variant.

Det är viktigt att notera att dessa rapporter är tidiga och en del av vetenskapen är det ännu inte peer-reviewed. Så, rekombinationsrollen i utvecklingen av SARS-CoV-2 behöver fortfarande bekräftas. En graf som visar rekombination mot ackumulerade mutationer. Lara Herrero, författare tillhandahållen

Enligt tidiga rapporter från Världshälsoorganisationen (WHO) visar genetisk sekvensering att stammen som cirkulerar i Vietnam är en Delta-stam som har utvecklats några ytterligare mutationer.

Vetenskapligt, och Enligt WHO, det betyder att det inte alls är en ”hybrid”. Snarare är det en muterad version av Delta-varianten.

Delta-varianten upptäcktes ursprungligen i Indien och har sedan dess spridit sig över hela världen, inklusive till Australien. Tidiga rapporter tyder på att det är mer överförbart och möjligen mer dödligt än andra varianter, ledande hälsovårdsmyndigheter, inklusive i Vietnam, är i hög beredskap.

Vi vet ännu inte detaljerna om vilka extra mutationer som finns i Vietnam-versionen av Delta-varianten. Men vi har sett detta fenomen tidigare, där mutationer som är kända i en variant rapporteras ha ackumulerats i en annan SARS-CoV-2-variant. En infografik som visar rekombination mot ackumulerade mutationer. Rekombination är när två stammar av ett virus infekterar en person samtidigt och kombineras för att bilda en ny stam. Lara Herrero, skapad med BioRender, författare tillhandahållen

Vad vi vet och inte vet

I slutet av förra månaden rapporterade vietnamesiska hälsotjänster att den så kallade hybridvarianten som cirkulerade var mycket farlig och mer överförbar än andra virusstammar. De sa att det låg bakom ökade infektioner Vietnam upplevde under maj.

Dessa initiala rapporter baserades på kliniska observationer. Huruvida den här muterade varianten är mer smittsam och i vilken grad den kan impliceras i Vietnams nuvarande infektionsflod är ännu inte säkert.

När någon diagnostiseras med COVID-19 är det inte alltid vanligt att utföra sekvensering av helgenomen på deras virusprov. Det är ofta en dyr och tidskrävande process som genomförs av folkhälsovården, epidemiologer och virologer att förstå och förutsäga rörelsen av ett utbrott.

Detta betyder att inte alla länder kommer att ha kapacitet att snabbt tillhandahålla SARS-CoV-2-sekvenser av hela genomet. Så de exakta detaljerna om vilken belastning som cirkulerar var kommer alltid efter rapporter om ärendenummer.

Det är troligt att vi ännu inte vet om denna förändrade Delta-stam är den dominerande som cirkulerar i Vietnam. Vietnam har antingen ännu inte genomfört fullständig analys av genomdata från tillräckligt många patientprover eller är ännu inte tillgänglig för allmänheten.

Dessutom vet vi ännu inte om den här muterade varianten är mer överförbar eller orsakar allvarligare COVID-19 än Delta-varianten eller den ursprungliga SARS-CoV-2. Vi vet inte heller om det kommer att påverka hur bra COVID-vacciner fungerar.

För att svara på dessa frågor behöver vi mer detaljerade genomdata, tid för att se hur saker spelar ut i samhället, samt data från vetenskapliga och kliniska studier som involverar personer som är smittade med denna variant.

Nya namn

När COVID-19-pandemin fortsätter att utvecklas, så gör också SARS-CoV-2-stammarna som driver kaoset.

Ursprungligen var rapporterna inriktade påBrittisk variant"Eller"Indisk variant", och så vidare.

Med tanke på behovet av ett universellt namngivningssystem Vem har bedömt den genomiska klassificeringen av stammar och gav nya, mer allmänna namn baserat på det grekiska alfabetet.

Denna lista innehåller både "varianter av intresse" och "varianter av intresse". Medan Delta klassificeras som en orosmässig variant, listas inte denna förändrade Delta-variant upptäckt i Vietnam i detta skede.

För att kunna betraktas som en ny variant av viruset eller stammen, måste en variant göra det visa tydliga fysiska egenskaperoch beter sig därför annorlunda än det ursprungliga viruset eller en befintlig stam. Ur WHO: s perspektiv verkar detta inte vara fallet för den muterade Delta-stammen. Åtminstone inte än.

En stark påminnelse

Vietnam var ett land som var stolt över att innehålla viruset, med initial framgång i gränskontroll och folkhälsoåtgärder. Detta resulterade i perioder utan överföring av samhället. För närvarande spelar det in mer än 200 nya ärenden om dagen (den juni 10 det fanns 413).

Hybridstam eller inte, Vietnams situation borde vara en påminnelse för världen - och särskilt länder som Australien, med en lika god historia av att innehålla viruset - av den fortsatta betydelsen av social distansering och vaccination i vår kamp mot COVID-19.

Om författaren

Lara Herrero, forskningsledare inom virologi och infektionssjukdom, Griffith University
 
books_health

Denna artikel publicerades ursprungligen på Avlyssningen

TILLGÄNGLIGA SPRÅK

English afrikaans Arabic Förenklad kinesiska) Kinesiska (traditionell) danska Dutch Filippinare Finnish French German grekisk Hebreiska hindi ungerska Indonesian Italian Japanese Korean Malay Norwegian perser polska Portuguese rumänska Russian Spanish swahili Swedish Thai turkiska ukrainska urdu vietnamese

följ InnerSelf på

Facebookikon ikon~~POS=HEADCOMPtwitter iconyoutube iconinstagram ikonpintrest ikonrss-ikonen

 Få det senaste via e-post

Veckotidningen Daglig Inspiration

Nya Attityder - Nya Möjligheter

InnerSelf.comClimateImpactNews.com | InnerPower.net
MightyNatural.com | WholisticPolitics.com | InnerSelf Market
Copyright © 1985 - 2021 Innerself Publikationer. All Rights Reserved.