En genomisk undersökning av svampar som lever på vår hud ger ett ramverk för att förstå hur dessa mikrober bidrar till hudens hälsa och sjukdom.
Komplexa samhällen av mikrober lever på ytan av våra kroppar. Dessa svampar, bakterier och virus är kollektivt kallas huden microbiome. Ett team från NIH National Human Genome Research Institute (NHGRI) och National Cancer Institute (NCI) som tidigare använts genom tekniker för att studera hudbakterier. De fann olika bakteriella samhällen som varierade mellan människor och hudyta. I sin nya studie använde laget en liknande genomisk tillvägagångssätt för att få en bättre förståelse för de svampar som lever på vår hud.
Svampar innefattar formar, svamp och jäst som används för att jäsa bröd och öl. Dessa mikrober har förknippats med många hudsjukdomar och villkor, inklusive fotsvamp, eksem, mjäll och tånagel infektioner. Svamp hudinfektioner påverkar uppskattningsvis 29 miljoner människor i landet. Men svampar kan vara långsam och svårt att växa i laboratorier, vilket gör svampinfektioner svåra att identifiera och behandla.
I maj 22, 2013 samlade forskarna prover på 14-kroppsplatser från 10-friska vuxna. De fokuserade på ett fragment av DNA som delas av alla svampar - den intervenerande interna transkriberade spacern 1 (ITS1) av ribosomal RNA-som kan användas för att klassificera svampar på släktnivå med större än 97% -noggrannhet.
Genom att generera mer än 5 miljoner ITS1-sekvenser från proverna kunde teamet identifiera mer än 80-svamptyper som lever på mänsklig hud. I motsats till detta kunde traditionella odlingsmetoder endast identifiera 18-typer. hittades på alla hudplatser. var den övervägande typen på 11 på 14-ställena, inklusive bakom öronen, i näsborrarna, på ryggen och på armarna.
Teamet fann att klackar, som inte visar omfattande bakteriell mångfald, var den mest komplexa platsen för svampar, med omkring 80-typer representerade. Tånbanor, med omkring 60-typer och tånaglar, med 40, hade de näst högsta nivåerna av svampdiversitet. Händer och armar, som har en stor mångfald bakterier, hade relativt få typer av svampar. Svampsamhällen i kärnkroppen var ganska stabila över tiden, med liten förändring när de testades upp till 3 månader från varandra. Däremot förändrade svampar på fötterna avsevärt över 3 månader, vilket kanske återspeglade mer miljöexponering.
Svampsamhällen på människokroppen är komplexa och platsspecifika ", säger medförfattare Dr. Heidi Kong of NCI. Genom att få en mer fullständig medvetenhet om svamp- och bakterieekosystemen kan vi bättre ta itu med associerade hudsjukdomar, inklusive svampinfektioner, som kan relateras till cancerbehandlingar.
Uppgifterna från vår studie ger oss en grundlinje om normala individer som vi aldrig haft tidigare, säger medarbetare, dr. Julie Segre, NHGRI. Bottenlinjen är dina fötter dricker med svampdiversitet, så bära dina flip-flops i omklädningsrum om du inte vill blanda dina fotsvampar med någon annans svampar.
